Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG3Q9Y2Y8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms