Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GIT1Q9Y2X7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GIT1Q9Y2X7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIT1Q9Y2X7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms