Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTF2Q9UNY4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTF2Q9UNY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms