Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRAQ9UJ68 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms