Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUFIP1Q9UHK0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUFIP1Q9UHK0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms