Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLKQ9UBE8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NLKQ9UBE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms