Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XCL2Q9UBD3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms