Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD2Q9UBB5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD2Q9UBB5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms