Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGAP28Q9P2N2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP28Q9P2N2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms