Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
CC2D2AQ9P2K1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CC2D2AQ9P2K1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CC2D2AQ9P2K1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms