Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRBP1Q9P2E9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms