Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDH10Q9P2E7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDH10Q9P2E7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms