Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms