Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDND1Q9NY35 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDND1Q9NY35 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms