Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDL2Q9NX52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDL2Q9NX52 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms