Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT57Q9NWB7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT57Q9NWB7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms