Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EMILIN3Q9NT22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1090.7 ms