Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRP7BPQ9NSQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
RRP7BPQ9NSQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms