Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A11Q9NSA0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A11Q9NSA0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A11Q9NSA0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms