Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOPORSQ9NS56 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPORSQ9NS56 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms