Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHK2Q9NRA0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms