Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms