Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD93Q9NPY3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD93Q9NPY3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms