Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms