Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGAP3Q9NP61 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP3Q9NP61 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms