Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RETREG1Q9H6L5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RETREG1Q9H6L5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms