Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF41Q9H4P4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF41Q9H4P4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF41Q9H4P4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF41Q9H4P4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms