Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF39Q9H2S5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF39Q9H2S5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF39Q9H2S5 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms