Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC113Q9H0I3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC113Q9H0I3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms