Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLIRPQ9GZT3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLIRPQ9GZT3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms