Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NLRP1Q9C000 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NLRP1Q9C000 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms