Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A5Q9BY07 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC4A5Q9BY07 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms