Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP5Q9BXF6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms