Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC2P3Q9BVR0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC2P3Q9BVR0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms