Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT11Q9BT88 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT11Q9BT88 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms