Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT17Q9BSW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT17Q9BSW7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYT17Q9BSW7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms