Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC39A3Q9BRY0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A3Q9BRY0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms