Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF15Q99988 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF15Q99988 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF15Q99988 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDF15Q99988 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF15Q99988 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF15Q99988 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GDF15Q99988 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF15Q99988 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF15Q99988 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms