Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM209Q96SK2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM209Q96SK2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms