Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCCC1Q96RQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms