Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC38A2Q96QD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A2Q96QD8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC38A2Q96QD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC38A2Q96QD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC38A2Q96QD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC38A2Q96QD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC38A2Q96QD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC38A2Q96QD8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC38A2Q96QD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms