Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGLYRP2Q96PD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGLYRP2Q96PD5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGLYRP2Q96PD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms