Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK4Q96L34 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms