Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXL4Q96JB6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXL4Q96JB6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXL4Q96JB6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms