Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC10A4Q96EP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC10A4Q96EP9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms