Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf44Q96CB5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C8orf44Q96CB5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf44Q96CB5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms