Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUNDC1Q96C34 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RUNDC1Q96C34 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RUNDC1Q96C34 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms