Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC102AQ96A19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC102AQ96A19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms