Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A6Q92581 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A6Q92581 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms