Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HERVK_113Q902F9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERVK_113Q902F9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms